Los detalles de su origen, relaciones y habilidades han cambiado significativamente durante el curso de la publicación del personaje. Como se muestra en Amazing Fantasy #15 (agosto de 1962), Peter es mordido por una araña radiactiva en una exhibición científica y adquiere la agilidad y fuerza proporcional a la de un arácnido. Junto con su superfuerza, se gana la capacidad de adherirse a las paredes y techos. Inicialmente, con la búsqueda de sacar provecho de sus nuevas habilidades, Peter se pone un disfraz y, como "Spider-Man", se convierte en una novedosa estrella de la televisión. Sin embargo, alegremente ignora la posibilidad de detener a un ladrón en fuga e irónicamente, se topa con el mismo ladrón, que asesinó a su tío Ben. Spider-Man encuentra y somete al ladrón, y aprende que "un gran poder conlleva una gran responsabilidad".
A pesar de su poderes, Parker se esfuerza por ayudar a su viuda tía May a pagar el alquiler de su casa. Parker es molestado a veces por algunos de sus colegas (especialmente la estrella de fútbol, Flash Thompson) y, como Spider-Man, engendra la ira del editor J. Jonah Jameson. Cuando pelea contra sus enemigos por primera vez, Parker se encuentra haciendo malabares en su vida personal y se le dificulta aventurarse como Spider-Man. Con el tiempo, Peter se gradúa de la preparatoria y se inscribe en la Empire State University, donde se encuentra con su mejor amigo Harry Osborn y su primer interés amoroso Gwen Stacy, y su tía May le presenta a Mary Jane Watson. A medida de que su amigo Harry tiene problemas con las drogas, y el padre de Harry, Norman Osborn se revela como el némesis de Spider-Man, el Duende Verde, Peter ha intentado renunciar a su vida como Spider-Man por un tiempo. El padre de Gwen Stacy (George Stacy, detective de la policía de Nueva York) muere accidentalmente durante una batalla entre Spider-Man y el Doctor Octopus. En el curso de sus aventuras, Peter ha encontrado una gran variedad de amigos y contactos dentro de la comunidad de superhéroes, que a menudo van en su ayuda cuando se enfrenta a problemas que él no puede enfrentar por sí solo.
En la edición #121 (junio de 1973), el Duende Verde lanza a Gwen Stacy de una torre del puente de Brooklyn y muere durante el intento de rescate de Spider-Man. En la siguiente edición, el Duende Verde parece querer quitarse la vida en una batalla contra Spider-Man. Trabajando a través de su dolor, Parker finalmente desarrolla sentimientos tentativos hacia Mary Jane Watson, y los dos se convierten en más bien confidentes que en amantes. Peter se gradúa de la universidad en la edición #185, y se involucra con la tímida Debra Whitman y la extrovertida ladrona coqueta disfrazada, Felicia Hardy, la Gata Negra.
De 1984 a 1988, Spider-Man vistió un traje diferente a su original (de color negro con un diseño blanco de araña). Este nuevo traje se originó en la serie Secret Wars, en un planeta extraño, donde Spider-Man participa en una batalla entre superhéroes de la Tierra y algunos villanos. Los creadores revelaron entonces que el traje era un simbionte alienígena que Spider-Man fue capaz de rechazar después de una lucha difícil, aunque el simbionte ha regresado por venganza bajo la identidad de Venom.
En el 2005, Spider-Man seria asesinado por Morlun por un corto periodo de tiempo, ya que regresaría con más parte de su entidad araña en control. Después de esto se estrenaría Guerra Civil, una serie de cómics que trata de que el gobierno decide querer tomar el control de las acciones de los superhéroes. Iron-Man, el hombre de hierro, lo apoya, pero el Capitán América, el noble compatriota, lo opone. Al principio Spider-Man empieza en el equipo de Iron-Man, pero, luego de ver las atrocidades que puede hacer, se traslada al equipo de Capitán América. En el 2012, Spider-Man tiene un trabajo en Laboratorios Horizonte y es un miembro de los Vengadores, la Fundación del Futuro y de los Nuevos Vengadores. Luego tiene que enfrentar con la ayuda de otros héroes a el Doctor Octopus, que amenaza elevar el calentamiento global. En 2013 se estrenó The Superior Spiderman, en esta serie regular que reemplazó un tiempo a The Amazing Spider-Man, Otto Octavius cambiaba su mente al cuerpo de Peter dejando a este en el viejo cuerpo Octopus, en ese momento Otto le prometería al difunto Parker que se convertiría en un Spiderman superior. Un tiempo después Peter Parker volvería a tomar el control de su cuerpo provocando en relanzamiento de The Amazing Spiderman en 2014. Se revela que mientras Otto estaba en el cuerpo de Peter él había creado una compañía llamada Parker Industries, o Industrias Parker. Durante el crossover llamado Secret Wars se vería diferentes versiones del personaje, al igual que sus propias series de cómics y también se vería desarrollo en la serie del Spider-Man original mientras encuentra su lugar en esta serie de cómics casi apocalíptica. Después de el crossover, se iniciaría un nuevo universo de Marvel con todas sus realidades en un solo universo, todos viviendo en el planeta Battleworld, un mundo lleno de fragmentos de mundos que ya no existen. Este universo sería llamado "Totalmente Nuevo, Totalmente Distinto Marvel". A partir de Octubre del 2015, se lanza el nuevo volumen de The Amazing Spiderman(Vol #4), en donde nuestro trepamuros seguirá siendo el mismo, tan solo que ahora dirigirá su propia compañía, la ya mencionada Industrias Parker, al igual que un nuevo traje.
Poderes y habilidades
Peter siempre ha tenido una gran inteligencia, con grandes aptitudes en física y química, graduándose en bioquímica por la Universidad Empire State. Tras ser mordido por una araña radiactiva, obtuvo los siguientes poderes sobrehumanos:
Una gran fuerza, agilidad, poder trepar por paredes. La fuerza de Spider-Man le permite levantar 10 toneladas o más. Gracias a esta gran fuerza Spider-Man puede realizar saltos muy elevados.
Un "sentido arácnido", que le permite saber si un peligro se cierne sobre él, antes de que suceda. En ocasiones este puede llevar a Spider-Man al origen del peligro.
Esta habilidad no solo funciona con ataques sorpresa físicos, sino que en Spider-Island, Reed Richards le devuelve su Sentido, Kaine está a punto de dotarle la cura de sus poderes, y cuando vuelve este poder, instintivamente le guía para encontrar los puntos débiles de Kaine y así vencerlos. También, se sabe que esto lo vuelve inmune ante ataques telequinéticos y mentales (así que no puede ser controlado o hipnotizado), la única vez que no funcionó esto fue con el simbionte Venom. En ocasiones algunos super-villanos consiguen neutralizar esta habilidad, como es el caso de Venom (cómic) o Carnage o, que por su condición simbiótica previa con Spider-Man, eluden su sentido arácnido. Esta habilidad la ha perdido recientemente en una lucha contra los Mata-Arañas, sin embargo en los recientes sucesos de Spider Island dicha habilidad es recuperada gracias a la colaboración de Reed Richards y Max Modell de Horizon Labs.
Tras ser un gran genio en física y química crea una especie de bio-tela similar a la que usan las arañas, la bio-tela es guardada en unos pequeños cartuchos en sus muñecas, la desventaja es que si se le acaban necesita algo de tiempo para cambiar los cartuchos vacíos por unos nuevos. Sin embargo, tras las Guerras Secretas, Spider-Man obtuvo accidentalmente un simbionte,19 capaz de producir y lanzar telarañas orgánicas. Finalmente, Spider-Man decide deshacerse del simbionte, el cual es adquirido por Eddie Brock. Tras juntarse, deciden llamarse Venom y vengarse de Spider-Man. Hay una creencia errónea, (por los dibujos animados y por la película) de que el simbionte aumenta las habilidades de Spider-Man. Esto no tiene nada que ver con el cómic, ya que en el cómic solo le proporciona telaraña ilimitada y poder cambiar de vestimenta.
En una aventura de la colección The Spectacular Spider-Man que se enmarca dentro de los hechos conocidos como Vengadores: Desunidos (Avengers: Disassembled), Peter Parker obtuvo la capacidad de regenerar sus propias telas de araña por una mutación causada por un beso venenoso contra su voluntad por parte de la Reina. Finalmente Spider-Man perdería dicha capacidad.
En la saga de El Otro, las habilidades de Spider-Man se ampliarían, siendo mucho más rápido y fuerte de lo que era antes. Aparte de esto, descubriría cosas nuevas de sus poderes anteriores como que no solo se adhería a las paredes por manos y pies, sino por cualquier parte de su cuerpo. Además podía ver en la oscuridad como algunas arañas e incluso en situaciones de combate y/o tensión, le salían unos aguijones de las muñecas que inyectaban veneno paralizante a sus enemigos y que le servían en la lucha, como se ve durante la batalla con Morlun. Finalmente Spider-Man perdería dicha capacidad.
Luego de los eventos de One More Day,20 Spider-Man volvió a tener los mismos poderes y las mismas limitaciones que tenía antes de ser besado por la Reina y ser casi asesinado por Morlun.
Un "escudo psíquico" fue creado por el Doctor Strange,21 de tal forma que todo el mundo se olvidara de quién era Spider-Man, o que no se acordaran quién es bajo la máscara. Este "escudo" también permite que la identidad de Spider-Man siga siendo un secreto, haciendo que la gente que pudiera descubrirla termine llegando a nada, como en la saga "New Ways To Die", en donde Norman Osborn vio la cámara de Peter Parker sacando fotos a Spider-Man en una cornisa, en vez de pensar que Parker podía ser Spider-Man pensó que Spider-Man se saca fotos y se las da a Peter. Este "escudo" es tan poderoso que puede burlar el radar de Daredevil (quién podría identificar a Spider-Man por su latido del corazón). Spider-Man posee una factor de curación muy superior al humano, pudiendo curar una herida de bala en una noche sin dejar cicatriz alguna. Y puede aguantar la respiración hasta por 20 minutos.22